5403 sayılı Kanun m. 21/a, izinsiz yapıların yıkım masraflarının sorumlulardan tahsil edileceğini, m. 21/b ise toprak koruma projesine aykırılık halinde de masrafların sorumlulardan tahsil edileceğini belirtmektedir. Eğer yıkım, belediye veya il özel idaresi tarafından süresinde yapılmaz ve Bakanlık tarafından yapılırsa, masrafların tahsili nasıl gerçekleşir?
Kanun, bu durumda ilgili idarelere yönelik özel bir mali yaptırım öngörmektedir. 5403 sayılı Kanun'un 21. maddesinin ilgili fıkralarına göre, hakkında yıkım kararı alınan bir yapı, bir ay içinde ilgili belediye veya il özel idaresince yıkılmazsa, Bakanlık bu yıkımı kendisi yapabilir veya yaptırabilir. Bu durumda Bakanlık, yaptığı yıkım masraflarını '%100 fazlası ile' ilgili belediye veya il özel idaresinden tahsil eder. Bu bir nevi cezai şart niteliğindedir. Eğer ilgili idare bu bedeli ödemezse, kanun daha da etkili bir mekanizma öngörmüştür: Bu bedel, Hazine ve Maliye Bakanlığı veya İller Bankası tarafından, belediye veya il özel idaresinin genel bütçe vergi gelirlerinden aldığı paylardan kesilerek doğrudan Bakanlık hesabına aktarılır. Bu hüküm, yerel idareleri yasal görevleri olan yıkım işlemlerini zamanında yapmaya zorlamayı amaçlayan çok güçlü bir mali yaptırım mekanizmasıdır.