5607 sayılı Kanun Madde 11 uyarınca, el konulan kaçak akaryakıt hariç diğer eşya ve taşıtların muhafaza masraflarının karşılanmasında Kamu İhale Kanunu hükümleri uygulanır mı?

Hayır, uygulanmaz. Kanunun 11. maddesinin 6. fıkrası uyarınca, bu kapsamda yapılacak her türlü mal, araç, gereç ve hizmet alımlarında 4734 sayılı Kamu İhale Kanunu hükümleri uygulanmaz. (Referans: 5607 sayılı Kanun, Madde 11/(6))