CMK m. 91(4)'te düzenlenen ve kolluk amirlerinin gözaltı kararı verebildiği katalog suçlar arasında Terörle Mücadele Kanunu'nda (TMK) yer alan suçlar da sayılmıştır. Bu durumda, TMK kapsamındaki bir suçüstü halinde gözaltı süresi ve hâkim önüne çıkarma süresi nasıl uygulanır?
Bu durumda süreler açısından bir içtima ve özel kanun-genel kanun ilişkisi söz konusudur. TMK'nın 19. maddesi, terör suçlarında gözaltı sürelerine ilişkin özel düzenlemeler içerir ve bu süreler genellikle CMK'daki genel sürelerden daha uzundur. Ancak, CMK m. 91(4)'teki düzenleme, suçüstü halinde 'kolluk amirine' gözaltı kararı verme yetkisi tanıyan özel bir durumdur. Uygulamada, eğer bir terör suçu suçüstü halinde yakalanırsa ve şartları varsa, kolluk amiri CMK m. 91(4) uyarınca 48 saate kadar gözaltı kararı verebilir. Ancak bu sürenin sonunda durum derhal Cumhuriyet savcısına bildirilir. Savcı, gözaltının devamına karar verirse, artık süreç TMK'daki özel gözaltı sürelerine tabi olur. Yani savcı, TMK'daki daha uzun sürelere (gerekirse hâkim kararıyla uzatma dahil) göre işlem yapabilir. Kişinin hâkim önüne çıkarılma süresi de yine CMK m. 91(4)'ün son cümlesindeki özel kurala, yani bireysel suçlarda en geç 48 saat, toplu suçlarda en geç 4 gün içinde hâkim önüne çıkarılma kuralına tabidir. Bu süre, TMK'daki düzenlemelerden daha lehe ise öncelikle uygulanır.