Hükümlünün disiplin soruşturmasında muhakkik görevlendirilmesinin kanunda öngörülen süreden (2 gün) sonra yapılması, verilen disiplin cezasını geçersiz kılar mı?

Hayır, tek başına geçersiz kılmaz. Yargıtay 1. Ceza Dairesi'nin 2016/5079 E. sayılı kararında, soruşturmaya geç başlanmasının cezanın sıhhatine engel olmayacağı, ancak bu gecikmenin hükümlü aleyhine bir sonuç doğurmaması gerektiği (örneğin cezanın silinme süresinin uzamaması için infaz tarihinin öne çekilmesi) belirtilmiştir.