5275 sayılı Kanun m. 99'a göre, farklı mahkemeler tarafından verilmiş cezaların toplanması, bu kararların kesinleşmiş olmasını gerektirir mi?

Evet, gerektirir. Maddede açıkça 'bir kişi hakkında başka başka kesinleşmiş hükümler bulunur ise' ifadesi yer almaktadır. Dolayısıyla, henüz kesinleşmemiş bir mahkumiyet hükmü, toplama kararına dahil edilemez.