5275 sayılı Kanun m. 99'a göre toplama kararı, cezaların niteliğini veya infaz rejimini değiştirir mi?

Hayır, değiştirmez. Toplama kararı sadece koşullu salıverilme süresinin hesaplanması için yapılan matematiksel bir işlemdir. Her bir cezanın niteliği (örneğin terör suçu, adi suç vb.) ve tabi olduğu infaz rejimi (1/2, 2/3, 3/4) aynen korunur ve müddetnamede bu şekilde ayrı ayrı dikkate alınır.