Bir mahkemenin, başka bir mahkemede görülen bir dava ile kendi dosyasını birleştirmeye karar vermesi için diğer mahkemenin muvafakatini (onayını) alması gerekir mi?

Evet, gerekir. Yargıtay 4. Ceza Dairesi'nin E. 2018/7976 sayılı kararında da belirtildiği gibi, farklı mahkemelerdeki davaların birleştirilmesi için kural olarak mahkemeler arasında 'uyuşma' olması gerekir. Bir mahkemenin, diğer mahkemenin muvafakatini sormadan tek taraflı olarak birleştirme kararı vermesi usule aykırıdır.