Fazla çalışma veya tatil ücreti alacağının yazılı belge veya işveren kayıtlarına (puantaj, takograf vb.) dayanılarak ispatlanması durumunda yine de 'karineye dayalı makul indirim' yapılır mı?

Hayır, yapılmaz. Yargıtay içtihatlarına göre, bu indirim sadece alacakların tanık beyanı gibi takdiri delillerle ispatlandığı durumlar için geçerlidir. Çalışma olgusu yazılı belge gibi kesin delillerle kanıtlanmışsa, artık 'hayatın olağan akışına aykırılık' karinesine dayalı bir indirim yapılmasına gerek yoktur. (Bkz: YHGK, E. 2015/3555, K. 2018/184)